Der Trägerverein ist verantwortlich für den Betrieb der Schule der „Freien Christlichen Bekenntnisschule Molbergen“. Dieser Verein ist 2014 durch eine Elterninitiative gegründet worden, die ihr Grundrecht auf Gründung einer Bekenntnisschule wahrgenommen hat (siehe Grundgesetz-Artikel 7 Absatz 5). Der Verein setzt sich aus dem Vereinsvorsitzenden Alexander Langlets und mehreren aktiven Mitgliedern – vorwiegend Eltern – zusammen, denen die christlichen Grundwerte und eine christliche Erziehung ein Herzensanliegen sind.